Вирусы-бактериофаги атакуют бактерии, заражают их и в конце концов убивают — сразу или через несколько бактериальных поколений. Конечно, в некоторых случаях между вирусами и бактериями возникают и симбиотические связи, но по большей части они друг с другом находятся в тех же взаимоотношениях, что волки с оленями. И бактерии, выступающие в роли оленей, стараются защищаться. Копыт и рогов у бактерий, насколько мне известно, не наблюдается:), поэтому методы тут используются другие.
Например, бактерии используют специальные ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ. Это такие белки, которые разрезают длинную молекулу РНК или ДНК в определенном месте. Допустим, фермент рестрикции может узнавать лишь определенную последовательность нуклеотидов. Обычно эта последовательность состоит из четырех-восьми нуклеотидных оснований, которые могут идти друг за другом или прерываться вставками из других нуклеотидов. Такой участок, узнаваемый ферментом рестрикции, называется САЙТ РЕСТРИКЦИИ.
Ферменты рестрикции являются НУКЛЕАЗАМИ, поскольку словом «нуклеаза» мы называем любую молекулу, которая разрывает связи, соединяющие нуклеотиды в цепи. Причем бывают такие нуклеазы, которые работают только с РНК (рибонуклеазы), и такие, которые атакуют только молекулы ДНК (дезоксирибонуклеазы).
Если тебе хочется запомнить еще пару терминов, то это можно сделать:) Если нуклеаза отрезает крайний нуклеотид в цепочке, то такая нуклеаза называется ЭКЗОНАЗОЙ. А если нуклеаза разрезает ДНК или РНК в любых других местах, то это — ЭНДОНУКЛЕАЗА.
Итак, фермент рестрикции, находящийся внутри бактерии, рыщет в поисках такой РНК или ДНК, в которой находится узнаваемая им последовательность нуклеотидов. И если он находит ее, то набрасывается и разрезает ДНК или РНК в этом месте. Таким образом, если вирус впрыскивает внутрь бактерии свою молекулу наследственности, то нуклеазы ее могут поймать и уничтожить, разрезав на нефункциональные куски.
Но… как же бактерия защищает от своих же нуклеаз свои собственные, полезные РНК и ДНК?? Ведь эта нуклеотидная газонокосилка не спрашивает паспорта — она разрезает любые ДНК или РНК, в которых находит нужную ей последовательность нуклеотидов. Для этого бактерия МЕТИЛИРУЕТ такие участки своих молекул: специальные ферменты МЕТИЛАЗЫ привешивают к таким участкам метильную молекулу — CH₃, и нуклеаза не может к этому участку подобраться и разрезать его.